Cell | 建立人类树突状细胞与辅助性T细胞相互作用仿真

细胞核-细胞核相起着精神状态复杂，囊括大量分子可与路径途径，学界钻研多年，仍旧是管中窥豹。来自巴黎PSL研究者该大学的Vassili Soumelis团队于在Cell杂志上发表月不止版A Quantitative Multivariate Model of Human DendriticCell-T Helper Cell Communication的文章，创建了试验与论点借助于的研究者分析方法，试验上，在蛋白技拳法水平验证了细胞核所黏液的细胞核因子与应激反应；论点上，创建了路径输入负载二者之间的联系和相起着关系。译者以生命大脑皮质状细胞核（Dendritic cell，又称DC）与辅助性T细胞核（T Helper cell，又称Th）二者之间的相起着为研究者对象，分析了36例DC无关的路径分子可和17种Th黏液的细胞核因子，并倚靠这些资料库创建数学数学公式，演算不止56种已经被试验表明的细胞核相关系，与此同时，还推测不止290种也许关系，并表明了IL-12p70可以通过IL-1路径途径抑止17标准型辅助性T细胞核（又称Th17）。首先，译者采自了生命巨噬细胞核来源的DC（MoDCs）和泌尿系统肝脏CD11c+DC（bDCs）两类细胞核，并诱导24星期。所换用的诱导路径主要包含三大类共约14种。第一种：内源路径分子可，最主要干扰素beta（interferon β，又称IFN-β），GM-CSF， TSLP和 PGE2；第二种：Toll样肽的配基，最主要Toll4肽的低剂量脂多糖（ lipopolysaccharide，又称LPS），Toll1/2肽低剂量PAM3CSK4，Dectin1低剂量Curdlan，Toll2/Dectin1低剂量 zymosan，Toll7/8肽低剂量R848，Toll3肽低剂量 poly(I：C) 和NLRP3炎症小基底活化剂铝钾；第三种：细霉病毒，最主要高温灭活的Candida albicans （又称HKCA），李斯特霉（Listeria monocytogenes，又称HKLM），Staphylococcus aureus （又称HKSA）， Streptococcus pneumoniae （又称HKSP）和乙标准型肝炎（influenza virus，又称flu）。接依然，译者通过流式细胞核拳法等分析方法，验证了36种DC无关分子可的表达情况，其中，29种处于细胞核表面，7种处于细胞核黏液上清值得注意。结果显示，除了一些值得注意的DC细胞核自发值得注意，译者还有了一些原先找到：（1）zymosan诱导的MoDCs 表达高技拳法水平的CD54 和PVR；（2）乙标准型肝炎诱导的MoDCs可以抑止ICOSL；（3）LPS诱导的MoDCs 可以抑止高技拳法水平的CD30L和CD83。再依然，译者将这些诱导过的DC与T细胞核研究者生院6天，随后验证Th的诱导效率以及17种Th无关细胞核因子的表达黏液情况。有趣的是，译者将Th和DC的乏善可陈相比较，找到，这二者二者之间极为存在单射的关系，不一定，两种诱导物对DC激发的敏感度完全相同，但是，这两种诱导物所处理的DC与T细胞核研究者生院后来，激发的敏感度很可以大相迳庭。接着，译者换用生物信息学的分析方法，以上述试验资料库创建数学公式。简单来说，译者综合DC负载的36种路径分子可和Th负载的17种畸变分子可，将两两二者之间的关系简便为“正向抑制”和“对人抑制”两种，并且，还投身于资料库库和已发表文献中的信息，创建了复杂的路径抑制网络。例如，通过这一数学公式，译者找到， IL-10的对人抑制分子可最主要OX40L， 4-1BBL， IL-12， TNF-α， CD58， VISTA，Galectin-3， CD80， CD29， IL-1， ICAM-3， SLAMF3， IL-28a和CD83，而正向抑制分子可最主要Jagged-2， PDL1， IL-10， CD11a， HLA-DR， ICOSL， CD100， CD30L， CD18， ICAM-2和CD86，这样，给予DC各有不同的诱导路径，译者就可以推断不止Th自发细胞核IL-10的表达黏液情况。最后，译者借助于这样数学公式，正试图推测并表明原先细胞核相关系。通过创建的数学公式，译者找到，IL-12在与IL-1， ICAM-2或者Jagged-2共同完成黏液时，保守于抑制IL-17F，而与CD70， IL-23或者 LIGHT 共同完成注意到时，则更保守于抑制IL-17A。另外，敲除IL-12，IL-17A和IL-17F的表达技拳法水平都显着增加。这些结果说明，IL-12参与Th17的抑止变异。为了必要性探讨IL-12抑止Th17的系统，译者换用基底外抑止Th的数学公式，找到，IL-12极为能这样一来抑止Th17，但是，同时投身于IL-1和IL-12，Th17就抑止不止来了。这是一篇试验与论点借助于的经典作品。试验结果与近似值资料库分析相支持，相指导，相得益彰。如下图所示，试验均换用了密切关连两均资料库，一是何种诱导下DC细胞核的自发，二是自发后的DC对T细胞核的起着。论点均以DC和T细胞核的负载细胞核因子为一个中心，创建了细胞核因子二者之间的正向和对人抑制网络数学公式。通过这一数学公式，译者预测不止一些原先细胞核间相关系，再一再用试验表明这些关系确实子虚乌有。这一段话的看点有一处，一是创建和试验论点借助于研究者的便是，二是文章中提供的诸多细胞核抑制信息以供研究者参见。原始不止处：Grandclaudon M1, Perrot-Dockès M2, Trichot C1, et al.A Quantitative Multivariate Model of Human Dendritic Cell-T Helper Cell Communication.Cell. 2019 Oct 3;179(2):432-447.e21. doi: 10.1016/j.cell.2019.09.012.